Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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