Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms