Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4bG5E8Z2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms