Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms