Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms