Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms