Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms