Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ScaperF8VQ70 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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