Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms