Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17654F7AXR3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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