Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms