Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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