Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms