Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Crocc2F6XLV1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms