Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm42421F6X8D5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms