Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm10563F6WIE4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10563F6WIE4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms