Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp988F6VKC7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms