Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms