Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms