Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms