Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms