Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms