Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Urb2E9Q7L1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Urb2E9Q7L1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms