Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms