Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17728E9Q5K2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms