Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BC005561E9Q5E2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms