Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20518E9Q548 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms