Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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