Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms