Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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