Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Gm3893E9Q1I1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Gm3893E9Q1I1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Gm3893E9Q1I1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Gm3893E9Q1I1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Gm3893E9Q1I1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Gm3893E9Q1I1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Gm3893E9Q1I1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Gm3893E9Q1I1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm3893E9Q1I1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3893E9Q1I1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3893E9Q1I1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3893E9Q1I1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3893E9Q1I1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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