Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms