Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms