Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms