Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms