Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms