Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms