Protein–RNA interactions for Protein: E9PY60

Vmn1r77, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r77E9PY60 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r77E9PY60 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r77E9PY60 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r77E9PY60 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r77E9PY60 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r77E9PY60 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms