Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsf1E9PWW9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms