Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gimd1E9PW74 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms