Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms