Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifit3bE9PV48 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifit3bE9PV48 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms