Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms