Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl3E0CZ16 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms