Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wscd2D4PHA7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms