Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms