Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms