Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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