Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms