Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms